近年来，在市委、市政府的正确领导和大力支持下，沈阳医学院实现了一系列历史性跨越：本科教学工作水平评估获得优秀，办学实力获得教育部评估专家高度肯定；获得硕士学位授予权，实现了从“中专→大专→本科→研究生”办学层次的提升；顺利通过临床医学教育认证，在全国医学院校中走在认证工作前列。在不断积累、不断超越的过程中，学科建设不断增强，科研能力显著提高。“十一五”以来，病原生物学获批辽宁省优势特色重点学科、特色突出计划立项学科、提升高校核心竞争力特色学科。拥有2个辽宁省重点实验室，1个辽宁省高校重点实验室，6个沈阳市重点实验室。获得国家自然科学基金项目25项，承担省部级以上科研项目223项；被SCI、EI、ISTP三大国际公认检索数据库收录的论文达102篇；获得辽宁省科技进步奖10项，沈阳市科技进步奖38项，国家专利45项。

    近日，沈阳医学院科研成果“空气污染物对健康影响机制及其早期生物标志”又荣获辽宁省科学技术进步一等奖，实现了学校建校以来科研奖励新的突破，也是沈阳市属高校在该奖项上的历史性突破。

    “空气污染物对健康影响机制及其早期生物标志”系列研究依托辽宁省重点实验室“环境与微生态实验室”和辽宁省重点培育学科、优势特色重点学科病原生物学学科，在交叉学科环境污染与微生态研究领域，突破传统研究模式，首创模拟现实大气污染现状的混合污染物动物模型，在国内外率先开展了TSP、PM10、PM2.5，特别是PM2.5空气混合污染物的相关研究，首次将微生态学研究理论和方法应用到环境与健康研究领域，填补了国内外相关研究领域空白。该系列研究，先后获得4项国家自然科学基金项目、20项省市科研项目和1项国际合作资助项目，发表SCI收录等中英文论文68篇，培养博士、硕士研究生18人，研究专著《大气污染与呼吸道微生态》获得2013年辽宁省自然科学学术成果特等奖，相关研究成果写入《医学微生态学》研究生国家规划教材。